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首頁 健康 城大新法活檢RNA結合蛋白 有望研發治療新冠病毒藥物

城大新法活檢RNA結合蛋白 有望研發治療新冠病毒藥物

城大研究團隊開發嶄新檢測方法,能夠檢測活細胞內與非編碼RNA(核糖核酸)結合的蛋白質。這項新技術有望應用於癌症診斷與幹細胞研究,甚至有助找出治療新型冠狀病毒的潛在藥物靶點。

編輯精選 作者: 編輯精選
2020-08-14
灼見醫療

圖片:香港城市大學

標籤: RNA基因編輯新冠肺炎新型冠狀病毒核糖核酸癌症蛋白質
(前排左起)張亮博士、嚴健博士和陳居明博士及其研究團隊開發了名為CARPID的檢測方法,能夠快速檢測活細胞內與任何目標RNA結合的蛋白質。
(前排左起)張亮博士、嚴健博士和陳居明博士及其研究團隊開發了名為CARPID的檢測方法,能夠快速檢測活細胞內與任何目標RNA結合的蛋白質。
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香港城市大學(城大)的研究團隊開發嶄新檢測方法,能夠檢測活細胞內與非編碼RNA(核糖核酸)結合的蛋白質。這項新技術有望應用於癌症診斷與幹細胞研究,甚至有助找出治療新型冠狀病毒的潛在藥物靶點。

非編碼RNA被普遍認為是表觀遺傳調控的重要因子,並與許多疾病的形成有關。然而,要明確了解它們與活細胞中蛋白質之相互作用,有很大技術局限,因此其生物功能仍是未解之謎。

為進一步揭示其作用以作出診斷或治療,研究團隊開發了名為「以CRISPR輔助檢測RNA與蛋白質相互作用」(CARPID)的新技術,可以靈敏地在活細胞中檢測與目標RNA結合的蛋白質。

這項研究由城大生物醫學系副教授嚴健博士、張亮博士和陳居明博士共同領導。研究結果早前在科學期刊《自然方法》上發表,題為「以CRISPR輔助檢測活細胞內RNA與蛋白質相互作用」。該刊的影響因子(Impact Factor)在生物醫學領域位列第一。

研究團隊借助現時最先進的基因編輯技術CRISPR/dCasRx系統導航,找出目標RNA,再運用鄰近生物素標記技術,找出活細胞中RNA與蛋白質的相互作用。

用於識別特定非編碼RNA結合蛋白的質譜儀。

診斷癌症的生物標誌物

研究團隊認為CARPID的應用範圍廣泛,包括檢測病毒RNA的結合蛋白。嚴博士說:「舉個例子,SARS-CoV-2就是一種引起新型冠狀病毒的RNA病毒。一旦細胞受病毒感染,我們可以用CARPID來檢測該RNA病毒在病毒生命周期中與哪些細胞蛋白結合。如果能夠減少這些結合蛋白的數量,或許可以抑制病毒的複製。這些資訊可能有助找出潛在的抗病毒藥物靶點。」

張博士指出,由於非編碼RNA在癌細胞的數量比在正常細胞內高出很多,因此被視為診斷癌症的生物標誌物。如果可檢測癌細胞中這些非編碼RNA的結合蛋白,或有助找出致癌機制及用於癌症診斷或治療的潛在藥物靶點。研究團隊亦會嘗試將新方法應用於幹細胞研究。

此外,該檢測可在活細胞中進行,並在生理狀態下完全恢復RNA與蛋白質之間的相互作用;同時能夠靈敏地檢測出任何長度或濃度的RNA結合蛋白,而大部分現有方法只能應用於較長的非編碼RNA。

陳博士、嚴博士、張博士是論文的共同通訊作者。論文的共同第一作者是生物醫學系博士生李靖宇和朱孝軒,以及來自西安西北大學的易文凱和王曦博士。

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